123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3324 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
185 aa  377  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3108  TetR family transcriptional regulator  97.84 
 
 
185 aa  370  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3354  TetR family transcriptional regulator  97.84 
 
 
185 aa  370  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3326  transcriptional regulator, TetR family  97.84 
 
 
185 aa  369  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3313  TetR family transcriptional regulator  97.3 
 
 
185 aa  368  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.212765  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3094  TetR family transcriptional regulator  96.76 
 
 
185 aa  364  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.432559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
213 aa  77.8  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  21.28 
 
 
203 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 
208 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 
202 aa  58.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 
206 aa  55.1  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  21.2 
 
 
218 aa  55.1  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
211 aa  51.6  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  22.04 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  25.55 
 
 
219 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 
211 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
211 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
211 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  38.46 
 
 
194 aa  48.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
211 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
204 aa  48.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
211 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
209 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
211 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
211 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4592  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4223  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4626  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4607  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 
194 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
201 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0628  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447139  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
335 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  26.87 
 
 
197 aa  45.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4382  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
212 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4721  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
212 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
204 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4577  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 
212 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 
199 aa  45.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
223 aa  45.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 
189 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 
212 aa  44.7  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
223 aa  45.1  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 
201 aa  45.1  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  22 
 
 
256 aa  44.7  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
210 aa  44.7  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  25.17 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
224 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3794  putative TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  22.03 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  23.85 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
261 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  24.26 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
194 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3254  putative transcriptional regulator  21.64 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
220 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 
212 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  22.44 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 
225 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 
255 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 
202 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
202 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  37.04 
 
 
196 aa  42.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 
190 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 
195 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
211 aa  42  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
213 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
240 aa  42  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
203 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0242  regulatory protein, TetR  18.92 
 
 
188 aa  42  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.76 
 
 
211 aa  42  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.76 
 
 
211 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.76 
 
 
211 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.76 
 
 
211 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.76 
 
 
211 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  19.21 
 
 
206 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 
203 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
285 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 
191 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  21.81 
 
 
203 aa  42  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>