More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11503 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  371  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  83.96 
 
 		 187 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  83.33 
 
 		 187 aa  314  5e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  82.26 
 
 		 192 aa  310  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  82.26 
 
 		 192 aa  310  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  81.72 
 
 		 192 aa  308  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  72.04 
 
 		 189 aa  267  7e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  62.23 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  67.57 
 
 		 198 aa  224  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  58.03 
 
 		 198 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 190 aa  211  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  56.61 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  56.15 
 
 		 186 aa  198  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  51.32 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  44.29 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  43.08 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  38.46 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  47.92 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  26.58 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  26.58 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  26.58 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  26.58 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  26.58 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  39.68 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 287 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  26.58 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  26.58 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 125 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  27.07 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 207 aa  52.4  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>