101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1822 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 224 aa  448  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  50.45 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  46.85 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  46.64 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  47.3 
 
 		 246 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  45.5 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  44.34 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  42.53 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  43.93 
 
 		 261 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 226 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  40.93 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  40.64 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 227 aa  118  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  39.13 
 
 		 251 aa  111  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  38.86 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  33.04 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  51.49 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 247 aa  98.2  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 283 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  31.84 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  48.11 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 237 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  40.83 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  30.04 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  26.87 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  30.04 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  25.55 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  28.32 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  26.13 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 206 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  34.78 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7911  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0417125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  33.71 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  39.24 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  25.24 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  19.01 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  41.94 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 201 aa  42  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 191 aa  42  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 184 aa  41.6  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 191 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>