238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8156 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  32.03 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 255 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 315 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  34.89 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  32.2 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  34.18 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 248 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  33.62 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 311 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  34.06 
 
 		 228 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  30.74 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 249 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 234 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  29.18 
 
 		 228 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  30.33 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  29.96 
 
 		 247 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 234 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 228 aa  95.5  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 267 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  31.22 
 
 		 266 aa  94  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  38.35 
 
 		 240 aa  93.2  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 283 aa  93.2  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 239 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 330 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  29.17 
 
 		 248 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 342 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 224 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 223 aa  89  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  27.93 
 
 		 239 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 249 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.91 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  40.87 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  24.15 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>