225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8685 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  100 
 
 		 228 aa  450  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 283 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  47.33 
 
 		 248 aa  104  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 223 aa  104  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  35.02 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 249 aa  101  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  37.75 
 
 		 247 aa  98.2  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 265 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  32.9 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  34.6 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  49.12 
 
 		 342 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 249 aa  95.5  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 234 aa  95.1  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  38.76 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  35.21 
 
 		 311 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 272 aa  92  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 281 aa  92  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 239 aa  91.7  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  34.2 
 
 		 250 aa  91.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 247 aa  91.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 268 aa  91.7  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  39.13 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 283 aa  89.4  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 255 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  39.72 
 
 		 343 aa  86.3  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  40.15 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  31.42 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  31.05 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  40.34 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  34.7 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  32.87 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  46.94 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  38.73 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  38.05 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  43.18 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  34.97 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>