145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3152 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  49.36 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  44.73 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  42.74 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 269 aa  148  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  45.96 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  38.56 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  40.85 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 272 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 304 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 255 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  30.74 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  42.07 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  34.62 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  31.58 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  33.88 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  32.55 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  43.09 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  31.54 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 315 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  32.16 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  38.54 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  25.96 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  30.92 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  28.15 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  41.03 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  25.11 
 
 		 231 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  26.43 
 
 		 208 aa  49.7  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  29.31 
 
 		 226 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  28.81 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 272 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>