156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24780 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 220 aa  453  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  41.26 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  31.02 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  27.57 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  38.55 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  44.07 
 
 		 342 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  29.85 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 343 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  26.19 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 256 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 250 aa  48.5  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  29.93 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1491  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  23.29 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  32.08 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 255 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 253 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 245 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 268 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 268 aa  45.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 225 aa  45.1  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  33.9 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  32.93 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  26.42 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  35.48 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  48.78 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>