180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1196 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 228 aa  457  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  48.25 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  39.27 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 194 aa  95.1  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 298 aa  92  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 199 aa  92  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  27.7 
 
 		 194 aa  52  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 182 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  29.35 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  29.35 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  29.35 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  28.26 
 
 		 198 aa  48.5  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 205 aa  48.5  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  28.26 
 
 		 202 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 198 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4006  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 412 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 412 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 412 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 291 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 208 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 213 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 209 aa  45.1  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 229 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 242 aa  45.1  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1242  transcriptional regulator, TetR-family  33.33 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  38.46 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  25.54 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  34.48 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>