More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1666 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 203 aa  124  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 269 aa  104  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 200 aa  98.6  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 203 aa  94.7  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 298 aa  92.8  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 228 aa  81.3  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  33.15 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  21.65 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 437 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  24.35 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  25.73 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  25.29 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 453 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0104  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000798599  hitchhiker  0.000000102912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 349 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2300  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2347  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0682211  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  28.17 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 357 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>