More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1807 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  393  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  44.02 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  45.56 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 298 aa  112  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  25.89 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6166  putative transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  0.0100509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  28.43 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0811  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.646976  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  24.82 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  31.33 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  20.71 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3751  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0636766  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  23.4 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 219 aa  48.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 225 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  25.68 
 
 		 189 aa  48.1  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  15.76 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>