288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3882 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  44.09 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8769  putative transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 		 202 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  41.4 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 196 aa  98.6  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3751  putative transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 178 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0636766  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5669  regulatory protein TetR  39.41 
 
 		 190 aa  88.2  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 244 aa  61.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 235 aa  51.2  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  42.55 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3108  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  34.15 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  44 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 238 aa  48.5  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 225 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 208 aa  48.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 233 aa  48.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 228 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 188 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 188 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 438 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  38.89 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  20.51 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  23.73 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  29.07 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 335 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  39.76 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  39.76 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  34.09 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 258 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>