More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0899 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
193 aa  382  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 
204 aa  101  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
219 aa  98.2  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  25.52 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
243 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 
203 aa  79  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 
204 aa  61.6  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  29.23 
 
 
207 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
215 aa  58.2  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 
199 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
256 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  26.74 
 
 
203 aa  55.1  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  23.28 
 
 
204 aa  55.1  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
207 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  21.35 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
214 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
221 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  40.28 
 
 
213 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 
233 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 
227 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  28.9 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 
217 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 
193 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
197 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
219 aa  51.6  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 
194 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
192 aa  51.2  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 
224 aa  51.6  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 
201 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  21.74 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.75 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
285 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  23.38 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  38.6 
 
 
287 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  21.35 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3653  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  21.35 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.451581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
232 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 
228 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  22.49 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 
241 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
243 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3580  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  21.35 
 
 
220 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3750  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  21.35 
 
 
220 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.833551 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2322  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
201 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3687  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  20.79 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0386851 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 
192 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 
205 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 
203 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
221 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 
202 aa  48.9  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
226 aa  48.5  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
214 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2592  regulatory protein TetR  30.53 
 
 
234 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28583  normal  0.135199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 
208 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
219 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
203 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  43.1 
 
 
315 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 
236 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>