145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2097 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  371  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  78.69 
 
 		 206 aa  293  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  43.55 
 
 		 202 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4631  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4117  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  30.82 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  30.46 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 216 aa  48.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  43.28 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 307 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 225 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  26.74 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 238 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 217 aa  44.7  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 207 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 225 aa  44.7  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 216 aa  44.7  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 202 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  27.4 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0100  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  25.65 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  34.17 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  27.46 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  25.95 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  47.92 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 424 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  27.49 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  24.54 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 254 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  21.05 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  32.58 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  21.01 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 215 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>