59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6134 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6134  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0948812  normal  0.0489287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 349 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  31.76 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  22.75 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  22.46 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 197 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  23.66 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 298 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 196 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 198 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  39.62 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 193 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 193 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6166  putative transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  0.0100509 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  25.55 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  23.49 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  21.56 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  28.3 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1851  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 162 aa  42.7  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  21.3 
 
 		 200 aa  42.4  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 219 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 219 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 219 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 217 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 202 aa  41.6  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2288  regulatory protein, TetR  22.51 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  36.73 
 
 		 198 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>