202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8769 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8769  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  51.2 
 
 		 216 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  47.74 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  47.69 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 205 aa  154  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 		 190 aa  138  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3751  putative transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 178 aa  124  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0636766  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  37.57 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 200 aa  104  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5669  regulatory protein TetR  30.11 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  30.88 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  43.14 
 
 		 233 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 263 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  43.14 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 332 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  30.77 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  33.33 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  34.85 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 316 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 317 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  34.85 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 316 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 316 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 318 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 318 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 318 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 318 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 230 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 272 aa  45.1  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 234 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  43.4 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 247 aa  45.1  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 273 aa  44.7  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 276 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 210 aa  44.7  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 210 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 210 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  23.76 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  31.25 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  31.25 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>