More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1339 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 308 aa  616  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  54.14 
 
 		 287 aa  305  8.000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 207 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 212 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  30.38 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  60 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6166  putative transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  0.0100509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2789  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 192 aa  67  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  25.68 
 
 		 203 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  55.17 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  28.99 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  28.99 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  28.99 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  28.99 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  26.32 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 190 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4351  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.710621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  26.88 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  25 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 230 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  25.12 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1805  hypothetical protein  29.55 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  24 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 203 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 199 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  27.47 
 
 		 198 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 196 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  27.47 
 
 		 201 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 195 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 199 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 192 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 199 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 206 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  27.61 
 
 		 201 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  25 
 
 		 202 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 194 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 213 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 194 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  26.49 
 
 		 195 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  27.04 
 
 		 208 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  25.56 
 
 		 194 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 349 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 202 aa  52.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 206 aa  52.8  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 195 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  26.49 
 
 		 195 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  26.49 
 
 		 195 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  26.11 
 
 		 195 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  24.29 
 
 		 194 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0681  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  25.43 
 
 		 194 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 185 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 196 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 195 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  25.43 
 
 		 194 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  26.28 
 
 		 197 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  25.43 
 
 		 194 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  26.49 
 
 		 195 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  25.97 
 
 		 202 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 212 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  26.49 
 
 		 195 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  28.32 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>