102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1805 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1805  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 
308 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
181 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6166  putative transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  0.0100509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  24.26 
 
 
287 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 
195 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
245 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 
199 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 
205 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
391 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  30.5 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
185 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 
242 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
193 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
193 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
193 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 
197 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 
216 aa  44.7  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  23.45 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  23.45 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  23.45 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  23.45 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  23.45 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  23.57 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  27.87 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 
219 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
206 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
195 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
194 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
194 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
227 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
201 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 
184 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 
194 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 
182 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0684  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
197 aa  42.4  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.84339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  23.45 
 
 
178 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  23.45 
 
 
178 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 
205 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  23.45 
 
 
178 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.73 
 
 
216 aa  42.4  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 
205 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2371  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 
202 aa  42.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
87 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 
204 aa  42  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
201 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
206 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
257 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
185 aa  42  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1690  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
192 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.732657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1753  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
192 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
212 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
193 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
194 aa  42  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
234 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
190 aa  42  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1692  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 
192 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.474881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1586  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 
192 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 
203 aa  41.6  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
205 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
205 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 
175 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
203 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
203 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
243 aa  41.6  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  23.87 
 
 
193 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  29.87 
 
 
198 aa  41.6  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>