68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2371 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2371  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  401  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  32.94 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 367 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  31.18 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  27.96 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  31.18 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  27.27 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  28.92 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 251 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0039  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  50 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4166  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1711  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 195 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1805  hypothetical protein  34.04 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 212 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 192 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 223 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 196 aa  42  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  26.67 
 
 		 198 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 218 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  31.88 
 
 		 242 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  40.35 
 
 		 193 aa  41.2  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  26.37 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>