111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1711 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1711  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 177 aa  348  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1714  regulatory protein, TetR  86.36 
 
 		 190 aa  284  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.841461  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3334  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  26.53 
 
 		 212 aa  51.6  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 203 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  26.32 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 242 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 185 aa  48.5  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 194 aa  48.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 214 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3299  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 240 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  20.69 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.43 
 
 		 216 aa  45.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 216 aa  44.7  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 241 aa  44.7  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 219 aa  44.3  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  44.7  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2592  regulatory protein TetR  35.48 
 
 		 234 aa  44.3  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28583  normal  0.135199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  30.43 
 
 		 242 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 408 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  26.9 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 233 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  41.18 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3419  transcription regulation protein  25 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.909274  normal  0.462694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.43 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.43 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.43 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2371  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 446 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 212 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 204 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 202 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 196 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 237 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 236 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  42  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  19.71 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  21.43 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5813  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 243 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393234  hitchhiker  0.00386056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 185 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 198 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 205 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 231 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  43.94 
 
 		 197 aa  41.6  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 190 aa  42  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 221 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 220 aa  41.6  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 204 aa  41.6  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 242 aa  41.6  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  27.51 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 219 aa  41.2  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 223 aa  41.6  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 197 aa  41.2  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  41.2  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 199 aa  41.2  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>