More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3334 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3334  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1711  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1714  regulatory protein, TetR  29.1 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.841461  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  37.11 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  28.9 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.74 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.74 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.74 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  28.05 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  33.75 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.2 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 256 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 98 aa  51.6  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  30.93 
 
 		 264 aa  51.6  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3299  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  42.11 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  42.11 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.93 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3704  regulatory protein TetR  23.81 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  31.67 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.93 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.93 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>