More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3704 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3704  regulatory protein TetR  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  35.12 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  25.29 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 256 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3334  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  40 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 260 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  38.57 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  22.97 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 72 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  21.86 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  21.31 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  22.3 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  37.7 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 273 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  22.01 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  33.77 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  22.6 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  40.68 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  20.39 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  22.6 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1539  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  25.59 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  25.59 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>