More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3444 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  86.39 
 
 		 204 aa  343  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  79.51 
 
 		 205 aa  342  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  79.51 
 
 		 205 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  79.51 
 
 		 205 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  79.51 
 
 		 205 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  79.51 
 
 		 205 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  81.96 
 
 		 205 aa  333  7.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  73.66 
 
 		 205 aa  321  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  79.79 
 
 		 207 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  75 
 
 		 205 aa  316  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  71.71 
 
 		 205 aa  316  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  72.02 
 
 		 205 aa  293  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  63.41 
 
 		 205 aa  275  3e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  60.29 
 
 		 204 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  63.41 
 
 		 204 aa  257  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 206 aa  254  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  58.05 
 
 		 204 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 204 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  66.48 
 
 		 205 aa  250  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  64.97 
 
 		 204 aa  241  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  65.14 
 
 		 204 aa  241  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  60.44 
 
 		 204 aa  228  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  49.48 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  41.97 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  33.51 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 208 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 203 aa  88.6  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 204 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  25.28 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  28.22 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 470 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  26.51 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  27.21 
 
 		 400 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  29.86 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>