More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3419 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3419  transcription regulation protein  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.909274  normal  0.462694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4778  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329745 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2667  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000274018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  24.56 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2000  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  25.12 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2322  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  23.33 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 247 aa  52.4  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 247 aa  52.4  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 226 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 226 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 242 aa  51.2  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  21.51 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  28.67 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3975  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  24.08 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  33.93 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 218 aa  48.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 290 aa  48.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  48.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 408 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  19.89 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 307 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 291 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 271 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 310 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>