More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5814 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  48.42 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 194 aa  167  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  44.79 
 
 		 193 aa  157  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  50.54 
 
 		 195 aa  150  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  31.41 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 201 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 243 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  31.52 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
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NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 242 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  31.29 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
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NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  25.53 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
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NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  28.89 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
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NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
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NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
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NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  29.1 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
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NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  31.85 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
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NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
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NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2200  putative regulatory protein TetR  32.1 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.841471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_0558  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235529  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  26.19 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  27.75 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  25.79 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1711  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  38.38 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3068  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
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NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
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NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 242 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
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NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 400 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  25.62 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  26.35 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
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