More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0836 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2442  transcriptional regulator, TetR family  61.11 
 
 		 223 aa  232  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3535  TetR family transcriptional regulator  59.79 
 
 		 210 aa  221  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.926686  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  53.97 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  57.14 
 
 		 202 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  56.61 
 
 		 202 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  53.12 
 
 		 209 aa  207  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 199 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3641  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  41.18 
 
 		 205 aa  158  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0771  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  38.98 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  33.77 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 242 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 228 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 257 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  37.04 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  32.94 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  42.37 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04117  predicted transcriptional regulator  26.92 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 271 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4834  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04081  hypothetical protein  26.92 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>