200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3389 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 187 aa  360  8e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  52.2 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  42.08 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2442  transcriptional regulator, TetR family  43.17 
 
 		 223 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  43.17 
 
 		 202 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  43.17 
 
 		 202 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 199 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3535  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.926686  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  36.9 
 
 		 209 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 198 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3641  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0771  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 174 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 219 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  33.9 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  39.33 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 216 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 227 aa  48.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 317 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 207 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  34.67 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 271 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  33.06 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 209 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 239 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 214 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 330 aa  45.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3682  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 211 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 215 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 219 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 220 aa  44.7  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>