More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3535 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3535  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.926686  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  74.37 
 
 		 202 aa  285  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  70.85 
 
 		 202 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2442  transcriptional regulator, TetR family  69.12 
 
 		 223 aa  263  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  63.86 
 
 		 205 aa  258  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  62.87 
 
 		 209 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  59.79 
 
 		 199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  65.26 
 
 		 198 aa  235  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  63.3 
 
 		 198 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  61.7 
 
 		 199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  55.03 
 
 		 198 aa  205  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3641  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 197 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  46.24 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0771  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 174 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 271 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 330 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  36.99 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 257 aa  52  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  44.78 
 
 		 233 aa  51.6  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  24.03 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  32.23 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  40.28 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 388 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 250 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  36.73 
 
 		 258 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 250 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 191 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>