213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0771 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0771  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  408  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  37.91 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  40.72 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3535  TetR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.926686  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2442  transcriptional regulator, TetR family  42.76 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  49.58 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  44.2 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 		 202 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  32.69 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3641  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 187 aa  91.7  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  39.33 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  30.07 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  33.61 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  40.96 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  33.61 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  21.61 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 261 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 174 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 225 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 248 aa  48.1  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  42.31 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3682  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 330 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  41.79 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  34.38 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 317 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>