149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1753 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1690  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1753  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1692  transcriptional regulator, TetR family  99.48 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.474881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1586  transcriptional regulator, TetR family  99.48 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1767  TetR family transcriptional regulator  98.44 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2060  TetR family transcriptional regulator  66.32 
 
 		 191 aa  266  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  24.47 
 
 		 287 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0681  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 225 aa  51.6  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 227 aa  51.2  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  25.27 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 240 aa  48.5  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  22.42 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 193 aa  47.8  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2789  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  23.21 
 
 		 308 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 285 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  23.7 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 349 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 233 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  24 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 227 aa  45.1  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 210 aa  44.7  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 367 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  26.42 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 333 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 286 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  26.35 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  29.41 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>