More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2422 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  39.43 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 367 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 198 aa  92  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  36.6 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 215 aa  88.2  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 207 aa  87  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  46.22 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  35.36 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  33.9 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  35.18 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 245 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  42.28 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2212  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326547  normal  0.584634 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  43.56 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2069  regulatory protein, TetR  38.3 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168032  normal  0.867534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  34.8 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  34.8 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  27.78 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  27.96 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  31.91 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  44.58 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  24.87 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  35.06 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  31.03 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  33.82 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  30.05 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  30.05 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  30.05 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  28.72 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  30.14 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  33.57 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>