182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5183 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  38.16 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  38.78 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 203 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  36.36 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 367 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  40.16 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  36.8 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  40.52 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  39.09 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  34.93 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 308 aa  62  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 177 aa  62  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  33.88 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  28.36 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  30.71 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  23.62 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  35.62 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  26.32 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  24.59 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  24.59 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  25.87 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  25.54 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  29.77 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  29.77 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  24.86 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  24.86 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  24.86 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  24.86 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  27.13 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 125 aa  48.1  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1851  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 162 aa  48.1  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 181 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  31.28 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  24.04 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2069  regulatory protein, TetR  34.62 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168032  normal  0.867534 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  28.35 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  25 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1071  regulatory protein, TetR  27.7 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0689162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  27.87 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>