289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5235 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  37 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  40.88 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  46.02 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  30.81 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  38.46 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  45.83 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  39.82 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  32.7 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 280 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 349 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  38.81 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  30.26 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 178 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  34.18 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  37.21 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  31.84 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  42.11 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  42.11 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  42.11 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2212  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326547  normal  0.584634 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  42.11 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  42.11 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  42.11 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  42.11 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>