131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5475 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  381  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  60.25 
 
 		 192 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 215 aa  98.6  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  34.62 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 206 aa  87.8  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 177 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  39.08 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  34.46 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  43.97 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  34.09 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  47.52 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  40.16 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  45.12 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  38.06 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  23.66 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  26.87 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  27.14 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3297  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  25 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  33.59 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  42.59 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  22.28 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  31.48 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  26.47 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  23.62 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4006  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 287 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>