More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27500 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  65.31 
 
 		 203 aa  256  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  45.99 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 269 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  37.14 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 199 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 214 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 197 aa  91.7  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  32.51 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  32.16 
 
 		 219 aa  84.7  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  31.19 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  37.67 
 
 		 346 aa  68.6  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  32.02 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  42.34 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  43.21 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  44.44 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0493  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  31.85 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 125 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  42.11 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.62 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  30.69 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 310 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 278 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 278 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 278 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>