More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3994 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 391 aa  781    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  72.89 
 
 		 406 aa  553  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  33.92 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 408 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 363 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  30.38 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 425 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  34.77 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  30.19 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 394 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 394 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 394 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 396 aa  109  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 194 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 197 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 225 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 206 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 190 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 193 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 214 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  27.21 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  32.14 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 199 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 197 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 197 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  38.46 
 
 		 200 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 197 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 240 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 210 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 209 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 197 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  29.2 
 
 		 210 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 219 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  39.39 
 
 		 224 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 206 aa  53.9  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 199 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 228 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 223 aa  53.9  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 201 aa  53.9  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 215 aa  53.9  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 210 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 278 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 195 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 204 aa  53.5  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 211 aa  53.5  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 226 aa  53.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 211 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 220 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 226 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.18 
 
 		 216 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 221 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 194 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 260 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 202 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 205 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>