More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4596 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 421 aa  845    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 403 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  50.61 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 205 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  30.46 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  27.5 
 
 		 201 aa  57  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0500  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 191 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6264  putative transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 196 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.085092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 238 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 212 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 200 aa  53.9  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 194 aa  53.9  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 214 aa  53.5  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 212 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 212 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1917  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 192 aa  53.1  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 214 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 202 aa  52.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 207 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 187 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0815  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 204 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 236 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 186 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 207 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 207 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8904  putative transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 207 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 190 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 207 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  25.39 
 
 		 264 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 278 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 277 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 278 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 234 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 278 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 202 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 200 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 208 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 213 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 194 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 193 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 235 aa  50.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 203 aa  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 251 aa  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 218 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 218 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 218 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 210 aa  49.7  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 239 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 239 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 218 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 205 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 195 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 195 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 214 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 205 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 233 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 233 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 207 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 207 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 200 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 204 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 205 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 209 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 206 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 206 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 283 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 204 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 200 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 214 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  47.06 
 
 		 224 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 239 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 233 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 215 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  36.67 
 
 		 206 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  43.1 
 
 		 226 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 196 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 206 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 215 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 233 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 215 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 206 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 233 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>