266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0500 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0500  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  32.43 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 421 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 423 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 217 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 217 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 414 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 233 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 403 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 268 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 226 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2875  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3071  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0385264  normal  0.592961 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  21.65 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 176 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 206 aa  47.8  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  40.74 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  43.14 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  25.26 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 264 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 245 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  39.58 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 236 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  27.36 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 234 aa  45.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>