More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0257 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3071  transcriptional regulator, TetR family  50.75 
 
 		 210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0385264  normal  0.592961 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  35.06 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 403 aa  61.6  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0500  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  27.54 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  25.9 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 423 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
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NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 414 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 383 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  31.61 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 291 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 253 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 232 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
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NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
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NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
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NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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