More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0161 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  397  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  39.5 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2781  regulatory protein TetR  32.4 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.83276  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2823  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335296  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  29.56 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2686  regulatory protein TetR  31.07 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  31.09 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 234 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3915  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 215 aa  51.2  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1185  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273145  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  26.23 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 244 aa  48.5  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  46.55 
 
 		 259 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6264  putative transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.085092 
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  25.88 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 191 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0374  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120665  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  36.51 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4140  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1759  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  27.55 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  22.03 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0679  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  39.68 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 255 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 423 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>