More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1166 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  86.12 
 
 		 210 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  83.25 
 
 		 210 aa  354  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  84.21 
 
 		 210 aa  353  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  83.73 
 
 		 210 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  82.78 
 
 		 209 aa  352  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
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NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  84.19 
 
 		 219 aa  350  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 213 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 208 aa  98.2  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  28.5 
 
 		 217 aa  96.3  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  33.54 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  30.8 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  31.31 
 
 		 224 aa  85.1  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
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NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  32.11 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
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NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  27.08 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
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NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  26.87 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  28.06 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0232  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  26.02 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  28.4 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  30.07 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
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NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  28.36 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  30.07 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
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NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009670  Oant_4809  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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