More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1945 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  33.53 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  23.78 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1712  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149018  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  52.73 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  26.62 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 540 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 181 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2875  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  30.53 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
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NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  30.13 
 
 		 264 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
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NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 307 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
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NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
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NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
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NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
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