More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6530 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  84.19 
 
 		 215 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  85.71 
 
 		 210 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  84.29 
 
 		 210 aa  359  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  85.24 
 
 		 210 aa  358  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  84.29 
 
 		 210 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  81.9 
 
 		 209 aa  351  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  34.6 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 217 aa  92  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  35.61 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  37.98 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0232  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  30 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  27.04 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  26.32 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  27.64 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  31.85 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  26.81 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  30.95 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
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NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
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NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
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NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
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NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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