More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2781 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2781  regulatory protein TetR  100 
 
 		 222 aa  427  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.83276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2686  regulatory protein TetR  98.08 
 
 		 222 aa  377  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1185  TetR family transcriptional regulator  97.58 
 
 		 223 aa  360  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  33.04 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3782  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.608196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  45.76 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  24.42 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  44.9 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  43.55 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 194 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3299  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  47.92 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 288 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  42.11 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 288 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  41.82 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0304  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 321 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 321 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  22.63 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 321 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 321 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 184 aa  49.7  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0743  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.803231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  32.14 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 199 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 271 aa  48.5  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.32 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.32 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 196 aa  48.5  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.32 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>