258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3782 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3782  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.608196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  32.99 
 
 		 197 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2686  regulatory protein TetR  34.31 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 191 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  33.82 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  40.28 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2781  regulatory protein TetR  30.15 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.83276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1185  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273145  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  38.98 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  30.95 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 305 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 257 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 244 aa  45.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 186 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4778  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329745 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  43.4 
 
 		 207 aa  45.1  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 230 aa  45.1  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0072  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 172 aa  45.1  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 212 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 208 aa  45.1  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 214 aa  45.1  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0094  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 172 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>