92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4778 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4778  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  403  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3419  transcription regulation protein  24.37 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.909274  normal  0.462694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2000  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2667  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000274018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2322  transcriptional regulator, TetR family  25.96 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  34.04 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3782  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.608196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  39.74 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 200 aa  44.7  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  27.78 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  26.67 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0406  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 376 aa  43.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  31.41 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  30.43 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 325 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 204 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 194 aa  42  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 288 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 211 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 202 aa  42  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 211 aa  42  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 239 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 287 aa  41.6  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  20.57 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  20.57 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  41.2  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  22.45 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 200 aa  41.2  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>