More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0316 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  42.58 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  35.9 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10277  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.133301 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0406  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  30.81 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  46.55 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  27.72 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 446 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  32.02 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 235 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4006  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 310 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 307 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 335 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>