284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2667 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2667  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000274018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3419  transcription regulation protein  42.25 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.909274  normal  0.462694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2000  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2322  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4778  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  22.63 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  22.45 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  27.4 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 229 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 228 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  19.55 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  20.33 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  20.33 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  18.25 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  18.9 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  30.77 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  17.65 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  17.65 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  21.05 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  29.09 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  21.88 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  20.75 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  17.89 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2718  transcriptional regulator, TetR family domain protein  39.39 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.087281  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  20.54 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  20.54 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28.12 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 228 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  36.73 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 203 aa  44.7  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 207 aa  44.7  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  44.7  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 187 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 246 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>