More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0414 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
202 aa  407  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
192 aa  169  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  22.04 
 
 
216 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
191 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 
191 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
191 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 
242 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 
190 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3419  transcription regulation protein  37.36 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.909274  normal  0.462694 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 
188 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
184 aa  55.5  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 
291 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 
193 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 
222 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
206 aa  54.7  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  24.84 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 
286 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  39.22 
 
 
251 aa  52.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 
72 aa  52.4  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.29 
 
 
216 aa  52.4  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
410 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 
202 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 
201 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  51.06 
 
 
191 aa  52.4  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
199 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
204 aa  52  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 
287 aa  51.6  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 
196 aa  52  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 
220 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 
210 aa  51.6  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
215 aa  51.6  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3515  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000109065  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
408 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  20.23 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.53 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  22.68 
 
 
266 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
243 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
288 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
206 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>