More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0026 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
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NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 273 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 288 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  21.52 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  24 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  27.52 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
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NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  22.49 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 412 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 412 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  35.71 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 412 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  20.39 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
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NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  35.48 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
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NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
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NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
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