More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1520 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  72.68 
 
 		 205 aa  311  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  72.68 
 
 		 205 aa  310  9e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1655  TetR family transcriptional regulator  76.1 
 
 		 207 aa  308  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.928806  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 194 aa  62  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  50 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0168  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  45.28 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 286 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  38.71 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 227 aa  51.6  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 224 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>